一種ATAC-seq測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201911070887.0 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN110838341A | 公開（公告）日 | 2020-02-25 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN110838341A | 申請(qǐng)公布日 | 2020-02-25 |
| 分類號(hào) | G16B20/00 | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 夏昊強(qiáng);周煌凱;高川;陶勇;羅玥;程祖福;邢燕;曾川川 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 廣發(fā)銀行股份有限公司廣州分行 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 廣州容大專利代理事務(wù)所（普通合伙） | 代理人 | 劉新年 |
| 地址 | 510000 廣東省廣州市廣州國(guó)際生物島螺旋三路6號(hào)第五層501、502單元 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供一種ATAC?seq測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析方法，包括以下步驟：對(duì)ATAC?seq測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析與質(zhì)控；將分析與質(zhì)控后的數(shù)據(jù)與參考基因組進(jìn)行比對(duì)分析；對(duì)單樣本Peak進(jìn)行檢測(cè)與統(tǒng)計(jì)；組內(nèi)一致性peak提取與分析；各處理組peak合并以及多樣本聚類分析；各處理組間共有和特有peak分析；組間peak豐度差異分析。本發(fā)明圍繞常規(guī)ATAC?seq測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行研究，構(gòu)建了一個(gè)分析內(nèi)容豐富的，能滿足個(gè)性化需求的常規(guī)ATAC?seq測(cè)序數(shù)據(jù)分析流程。分析結(jié)果揭示了全基因組范圍內(nèi)的染色質(zhì)開放區(qū)域的序列信息，并且可以幫助科研工作者進(jìn)一步探索找到或預(yù)測(cè)參與基因組開放性高低變化的轉(zhuǎn)錄因子。 |
