一種ATAC-seq測序數(shù)據(jù)的生物信息分析方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201911070887.0 申請日 -
公開（公告）號 CN110838341B 公開（公告）日 2021-05-18
申請公布號 CN110838341B 申請公布日 2021-05-18
分類號 G16B20/00 分類 物理
發(fā)明人 夏昊強;周煌凱;高川;陶勇;羅玥;程祖福;邢燕;曾川川 申請（專利權(quán)）人 廣發(fā)銀行股份有限公司廣州分行
代理機構(gòu) 廣州容大知識產(chǎn)權(quán)代理事務所（普通合伙） 代理人 劉新年
地址 510000 廣東省廣州市廣州國際生物島螺旋三路6號第五層501、502單元
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種ATAC?seq測序數(shù)據(jù)的生物信息分析方法，包括以下步驟：對ATAC?seq測序數(shù)據(jù)進行分析與質(zhì)控；將分析與質(zhì)控后的數(shù)據(jù)與參考基因組進行比對分析；對單樣本Peak進行檢測與統(tǒng)計；組內(nèi)一致性peak提取與分析；各處理組peak合并以及多樣本聚類分析；各處理組間共有和特有peak分析；組間peak豐度差異分析。本發(fā)明圍繞常規(guī)ATAC?seq測序數(shù)據(jù)進行研究，構(gòu)建了一個分析內(nèi)容豐富的，能滿足個性化需求的常規(guī)ATAC?seq測序數(shù)據(jù)分析流程。分析結(jié)果揭示了全基因組范圍內(nèi)的染色質(zhì)開放區(qū)域的序列信息，并且可以幫助科研工作者進一步探索找到或預測參與基因組開放性高低變化的轉(zhuǎn)錄因子。