一種檢測(cè)拷貝數(shù)變異的方法、裝置和存儲(chǔ)介質(zhì)
基本信息
申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010184960.3 | 申請(qǐng)日 | - |
公開(公告)號(hào) | CN111341383B | 公開(公告)日 | 2021-06-29 |
申請(qǐng)公布號(hào) | CN111341383B | 申請(qǐng)公布日 | 2021-06-29 |
分類號(hào) | G16B20/10(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I;G16B20/30(2019.01)I;G16B20/50(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I | 分類 | 物理 |
發(fā)明人 | 陳玥蘢;劉永初;李陽;劉陽;呂佩濤 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人 | 深圳雅濟(jì)科技有限公司 |
代理機(jī)構(gòu) | 深圳鼎合誠(chéng)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 李小焦;彭家恩 |
地址 | 518000廣東省深圳市龍華區(qū)龍華街道清湖社區(qū)寶能科技園6棟1901 | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本申請(qǐng)公開了一種檢測(cè)拷貝數(shù)變異的方法、裝置和存儲(chǔ)介質(zhì)。本申請(qǐng)檢測(cè)方法包括,獲取待測(cè)樣本DNA測(cè)序數(shù)據(jù)及其在人類參考基因組上各位置比對(duì)數(shù)據(jù)的步驟;統(tǒng)計(jì)待測(cè)樣本DNA在固定窗口區(qū)域內(nèi)深度的步驟;提取比對(duì)異常的數(shù)據(jù)序列,作為支持拷貝數(shù)變異第一維度結(jié)果的步驟;提取待測(cè)樣本DNA窗口深度與分布統(tǒng)計(jì)模型顯示出差異的窗口的步驟;判斷差異窗口差異是否顯著,能否得到第一維度結(jié)果支持的步驟;以及檢測(cè)結(jié)果輸出步驟。本申請(qǐng)檢測(cè)方法,通過對(duì)健康人群DNA的分布統(tǒng)計(jì)模型,能準(zhǔn)確區(qū)分真假拷貝數(shù)變異,結(jié)合另一維度結(jié)果,從不同角度確保拷貝數(shù)變異檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確性。本申請(qǐng)檢測(cè)方法,無需親緣對(duì)照樣本,能對(duì)單個(gè)樣本進(jìn)行拷貝數(shù)變異檢測(cè)。 |
