一種基于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)產(chǎn)物測序序列分型的實現(xiàn)方法和系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201010117703.4 申請日 -
公開（公告）號 CN101984445B 公開（公告）日 2012-03-14
申請公布號 CN101984445B 申請公布日 2012-03-14
分類號 G06F19/20(2011.01)I;C12Q1/68(2006.01)I 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 劉濤;樊清華 申請（專利權(quán)）人 中國農(nóng)業(yè)銀行股份有限公司深圳東部支行
代理機構(gòu) 中國國際貿(mào)易促進委員會專利商標(biāo)事務(wù)所 代理人 深圳華大基因科技有限公司;深圳華大基因健康科技有限公司
地址 518083 廣東省深圳市鹽田區(qū)北山工業(yè)區(qū)綜合樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開一種PCR-SBT分型方法和系統(tǒng)，該方法包括：通過計算機程序根據(jù)測序結(jié)果判讀雜合子位點和待分型堿基序列；將待分型堿基序列比對到對應(yīng)位點的分型數(shù)據(jù)庫，識別待分型堿基序列和分型數(shù)據(jù)庫的參考序列的聯(lián)配位置關(guān)系；檢索分型數(shù)據(jù)庫中的等位基因型，根據(jù)定序策略獲得分型數(shù)據(jù)庫中的等位基因型的罰分值；根據(jù)分型數(shù)據(jù)庫中的等位基因型的罰分值獲得候選型別組合集。本發(fā)明提供的SBT分型方法和系統(tǒng)，可以通過計算機等設(shè)備實現(xiàn)候選基因型的自動識別，從而提高了分型效率；通過圖形化顯示界面等技術(shù)手段為分型人員的分型確認(rèn)和修改提供方便，提供了分型準(zhǔn)確率以及分型效率。