一種基于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)產(chǎn)物測(cè)序序列分型的實(shí)現(xiàn)方法和系統(tǒng)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201010117703.4 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN101984445B 公開(kāi)（公告）日 2012-03-14
申請(qǐng)公布號(hào) CN101984445B 申請(qǐng)公布日 2012-03-14
分類(lèi)號(hào) G06F19/20(2011.01)I;C12Q1/68(2006.01)I 分類(lèi) 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù);
發(fā)明人 劉濤;樊清華 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 中國(guó)農(nóng)業(yè)銀行股份有限公司深圳東部支行
代理機(jī)構(gòu) 中國(guó)國(guó)際貿(mào)易促進(jìn)委員會(huì)專(zhuān)利商標(biāo)事務(wù)所 代理人 深圳華大基因科技有限公司;深圳華大基因健康科技有限公司
地址 518083 廣東省深圳市鹽田區(qū)北山工業(yè)區(qū)綜合樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開(kāi)一種PCR-SBT分型方法和系統(tǒng)，該方法包括：通過(guò)計(jì)算機(jī)程序根據(jù)測(cè)序結(jié)果判讀雜合子位點(diǎn)和待分型堿基序列；將待分型堿基序列比對(duì)到對(duì)應(yīng)位點(diǎn)的分型數(shù)據(jù)庫(kù)，識(shí)別待分型堿基序列和分型數(shù)據(jù)庫(kù)的參考序列的聯(lián)配位置關(guān)系；檢索分型數(shù)據(jù)庫(kù)中的等位基因型，根據(jù)定序策略獲得分型數(shù)據(jù)庫(kù)中的等位基因型的罰分值；根據(jù)分型數(shù)據(jù)庫(kù)中的等位基因型的罰分值獲得候選型別組合集。本發(fā)明提供的SBT分型方法和系統(tǒng)，可以通過(guò)計(jì)算機(jī)等設(shè)備實(shí)現(xiàn)候選基因型的自動(dòng)識(shí)別，從而提高了分型效率；通過(guò)圖形化顯示界面等技術(shù)手段為分型人員的分型確認(rèn)和修改提供方便，提供了分型準(zhǔn)確率以及分型效率。