一種快速檢測融合基因的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201710293318.7 申請日 -
公開（公告）號 CN107437002A 公開（公告）日 2017-12-05
申請公布號 CN107437002A 申請公布日 2017-12-05
分類號 G06F19/22(2011.01)I 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 閆成海;唐元華;徐健 申請（專利權(quán)）人 蘇州首度基因科技有限責任公司
代理機構(gòu) 北京恒泰銘睿知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 首度生物科技（蘇州）有限公司;蘇州首度基因科技有限責任公司
地址 215123 江蘇省蘇州市蘇州工業(yè)園區(qū)星湖街218號生物納米園B8樓5層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種快速檢測融合基因的方法，包括以下步驟：A.建立融合基因數(shù)據(jù)庫：將已知的融合基因斷裂點以及斷裂點前面的N個序列和斷裂點后面的M個序列組成種子，種子的集合形成融合基因數(shù)據(jù)庫；B.獲取待檢測基因;D.將種子與待檢測基因的序列數(shù)據(jù)比對，確定待檢測基因的序列數(shù)據(jù)是否包含種子信息；E.當包含待檢測基因包含種子信息時，則認為待檢測基因內(nèi)含有融合基因；否則認為不包含融合基因。本發(fā)明棄用了常規(guī)的融合基因?qū)ふ曳椒?，通過建立新的融合基因數(shù)據(jù)庫，采用執(zhí)果索因的方式，不需要與人類基因組進行比較，避免了既耗時又可能產(chǎn)生錯誤的比對基因組步驟，使得此種方法檢測速度可提高幾十倍，很少的內(nèi)存需求下完成分析,并且防止了比較錯誤引起的誤判。