一種SNP雜合樣本的半定量方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110205947.6 申請日 -
公開（公告）號 CN112899355A 公開（公告）日 2021-06-04
申請公布號 CN112899355A 申請公布日 2021-06-04
分類號 C12Q1/6869 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 萬謙;蔣小輝;向俊蓓 申請（專利權(quán)）人 成都新生命霍普醫(yī)學(xué)檢驗實驗室有限公司
代理機構(gòu) 成都行之專利代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 史麗紅
地址 610000 四川省成都市金牛區(qū)金泉路15號6棟1樓1號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種SNP雜合樣本的半定量方法，包括如下步驟：1）合成兩個長度相同的DNA模板P?ctDNA?1和P?ctDNA?2，兩者序列僅在中部的同一位點存在SNP差異；2）合成能通過PCR完全擴增P?ctDNA?1和P?ctDNA?2的引物P?ctDNA?3和引物P?ctDNA?4；3）按多種不同的比例混合P?ctDNA?1和P?ctDNA?2，得到P?ctDNA?2占比不同的DNA混合物；4）以步驟3）中混合物作為模板，以P?ctDNA?3和P?ctDNA?4為引物進行PCR擴增，然后回收條帶，再以P?ctDNA?3為引物進行Sanger一代DNA測序，獲得不同比例下SNP位點的測序圖譜。本發(fā)明通過人為合成兩種具有SNP差異的DNA模板，然后采用不同比例混合兩種DNA模板來模擬具有多態(tài)性的SNP雜合樣本，從而建立不同比例下SNP位點的重疊狀態(tài)圖譜，這樣僅僅依靠Sanger一代DNA測序得到SNP雜合樣本的圖譜即可初步判斷樣本的SNP雜合程度。