一種SNP雜合樣本的半定量方法
基本信息
申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202110205947.6 | 申請(qǐng)日 | - |
公開(kāi)(公告)號(hào) | CN112899355A | 公開(kāi)(公告)日 | 2021-06-04 |
申請(qǐng)公布號(hào) | CN112899355A | 申請(qǐng)公布日 | 2021-06-04 |
分類(lèi)號(hào) | C12Q1/6869 | 分類(lèi) | 生物化學(xué);啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學(xué);酶學(xué);突變或遺傳工程; |
發(fā)明人 | 萬(wàn)謙;蔣小輝;向俊蓓 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 | 成都新生命霍普醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司 |
代理機(jī)構(gòu) | 成都行之專(zhuān)利代理事務(wù)所(普通合伙) | 代理人 | 史麗紅 |
地址 | 610000 四川省成都市金牛區(qū)金泉路15號(hào)6棟1樓1號(hào) | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本發(fā)明公開(kāi)了一種SNP雜合樣本的半定量方法,包括如下步驟:1)合成兩個(gè)長(zhǎng)度相同的DNA模板P?ctDNA?1和P?ctDNA?2,兩者序列僅在中部的同一位點(diǎn)存在SNP差異;2)合成能通過(guò)PCR完全擴(kuò)增P?ctDNA?1和P?ctDNA?2的引物P?ctDNA?3和引物P?ctDNA?4;3)按多種不同的比例混合P?ctDNA?1和P?ctDNA?2,得到P?ctDNA?2占比不同的DNA混合物;4)以步驟3)中混合物作為模板,以P?ctDNA?3和P?ctDNA?4為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后回收條帶,再以P?ctDNA?3為引物進(jìn)行Sanger一代DNA測(cè)序,獲得不同比例下SNP位點(diǎn)的測(cè)序圖譜。本發(fā)明通過(guò)人為合成兩種具有SNP差異的DNA模板,然后采用不同比例混合兩種DNA模板來(lái)模擬具有多態(tài)性的SNP雜合樣本,從而建立不同比例下SNP位點(diǎn)的重疊狀態(tài)圖譜,這樣僅僅依靠Sanger一代DNA測(cè)序得到SNP雜合樣本的圖譜即可初步判斷樣本的SNP雜合程度。 |
