一種蛋白質(zhì)靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)優(yōu)化方法及系統(tǒng)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110436053.8 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)(公告)號(hào) CN113096725A 公開(kāi)(公告)日 2021-07-09
申請(qǐng)公布號(hào) CN113096725A 申請(qǐng)公布日 2021-07-09
分類(lèi)號(hào) G16B15/30(2019.01)I;G16B50/00(2019.01)I 分類(lèi) 物理
發(fā)明人 汝嘯;林子敬 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 宿州神農(nóng)量子科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京高沃律師事務(wù)所 代理人 王愛(ài)濤
地址 235300安徽省宿州市高新區(qū)黃淮石墨烯展示館南棟4樓4008室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開(kāi)了一種蛋白質(zhì)靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)優(yōu)化方法及系統(tǒng)。該方法包括:從蛋白質(zhì)靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)中提取靶點(diǎn)結(jié)構(gòu);所述靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)包括主鏈結(jié)構(gòu)和多個(gè)側(cè)鏈結(jié)構(gòu);所述主鏈結(jié)構(gòu)固定;按照設(shè)定順序依次對(duì)多個(gè)側(cè)鏈結(jié)構(gòu)的多個(gè)二面角進(jìn)行三自由度旋轉(zhuǎn),并判斷旋轉(zhuǎn)后的側(cè)鏈結(jié)構(gòu)數(shù)量是否達(dá)到預(yù)設(shè)結(jié)構(gòu)數(shù)量;若否,則繼續(xù)進(jìn)行三自由度旋轉(zhuǎn);若是,則對(duì)旋轉(zhuǎn)后的側(cè)鏈結(jié)構(gòu)采用DFTB方法進(jìn)行優(yōu)化并截??;截取之后,對(duì)剩余二面角進(jìn)行三自由度旋轉(zhuǎn),且每個(gè)二面角旋轉(zhuǎn)一次就采用DFTB方法進(jìn)行優(yōu)化并截取,直至所有側(cè)鏈結(jié)構(gòu)的所有二面角全部搜索完成。本發(fā)明通過(guò)可靠的構(gòu)象搜索方法與量子化學(xué)計(jì)算的結(jié)構(gòu)優(yōu)化,提供準(zhǔn)確可靠的靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)。