一種基于多核學(xué)習(xí)預(yù)測增強子及其強度分類方法及分類設(shè)備

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202111069507.9 申請日 -
公開(公告)號 CN114627964A 公開(公告)日 2022-06-14
申請公布號 CN114627964A 申請公布日 2022-06-14
分類號 G16B30/00(2019.01)I;G16B40/20(2019.01)I;G06K9/62(2022.01)I;G06N20/10(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 汪國華;李鴻飛;鄒權(quán) 申請(專利權(quán))人 電子科技大學(xué)長三角研究院(衢州)
代理機構(gòu) 哈爾濱市松花江專利商標(biāo)事務(wù)所 代理人 -
地址 150040黑龍江省哈爾濱市香坊區(qū)和興路26號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 一種基于多核學(xué)習(xí)預(yù)測增強子及其強度分類方法及分類設(shè)備,本發(fā)明涉及基于多核學(xué)習(xí)預(yù)測增強子及其強度分類方法及分類設(shè)備。本發(fā)明的目的是為了解決現(xiàn)有方法需要花費大量的人力物力去制備實驗所需的試劑,以及通過生物實驗注釋DNA片段功能,效率低的問題。過程為:獲取帶標(biāo)簽的DNA測序序列;使用三種特征描述符進行編碼轉(zhuǎn)換為向量;分別對得到的向量進行特征篩選獲得各自的F值,分別進行降維排序,選出各自對應(yīng)的最佳的特征子集;計算每個高斯函數(shù)對應(yīng)的最佳權(quán)重;構(gòu)建增強子預(yù)測模型;構(gòu)建強弱增強子預(yù)測模型;通過構(gòu)建好的增強子預(yù)測模型和強弱增強子預(yù)測模型對待測DNA測序序列進行判斷。本發(fā)明用于生物信息技術(shù)領(lǐng)域。