一種利用IIB型限制性內(nèi)切酶進行微生物群落鑒定的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201811467986.8 申請日 -
公開（公告）號 CN109584956B 公開（公告）日 2021-05-04
申請公布號 CN109584956B 申請公布日 2021-05-04
分類號 G16B20/00;G16B50/00 分類 物理
發(fā)明人 孫政;王師;黃適;包振民;王修評;呂佳;朱鵬飛;滕飛 申請（專利權(quán)）人 青島歐易生物科技有限公司
代理機構(gòu) 北京慕達星云知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（特殊普通合伙） 代理人 李冉
地址 266000 山東省青島市嶗山區(qū)株洲路20號海信創(chuàng)智谷A座第8層804房間
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種利用IIB型限制性內(nèi)切酶進行微生物群落鑒定的方法，步驟如下：利用IIB型限制性內(nèi)切酶對基因組DNA進行酶切；DNA酶切片段連接相應(yīng)數(shù)目種類的接頭，然后進行PCR擴增，擴增產(chǎn)物通過再次酶切擴增得到相應(yīng)數(shù)目的DNA文庫，將質(zhì)檢合格的DNA文庫進行高通量測序；建立“微生物IIB酶切組”數(shù)據(jù)庫，并找到針對物種在不同分類級上的特有序列，建立“微生物IIB酶切特有序列數(shù)據(jù)庫”；對測序獲得的序列數(shù)據(jù)進行質(zhì)量控制，保留含有酶切特異性位點的25bp?35bp的堿基片段。本發(fā)明的鑒定方法，既能保留宏基因組鳥槍測序優(yōu)點，又能解決成本問題，且具備處理痕量DNA的能力。