通過成組SNP位點(diǎn)檢測(cè)高通量測(cè)序樣本污染的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202010061621.6 申請(qǐng)日 -
公開(公告)號(hào) CN113136422A 公開(公告)日 2021-07-20
申請(qǐng)公布號(hào) CN113136422A 申請(qǐng)公布日 2021-07-20
分類號(hào) C12Q1/6869(2018.01)I;G16B20/20(2019.01)I 分類 生物化學(xué);啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學(xué);酶學(xué);突變或遺傳工程;
發(fā)明人 王學(xué)良;楊貴江;魯梅梅;劉蘊(yùn)奡 申請(qǐng)(專利權(quán))人 北京圣谷同創(chuàng)科技發(fā)展有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京華睿卓成知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 代理人 唐莉
地址 100000北京市海淀區(qū)北清路103號(hào)超然時(shí)代工業(yè)園3號(hào)樓1層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了通過成組SNP位點(diǎn)的突變情況檢測(cè)測(cè)序樣本是否被污染的方法,成組SNP位點(diǎn)是指一組或更多組成組SNP位點(diǎn),每一組成組SNP位點(diǎn)包括2個(gè)或更多個(gè)SNP位點(diǎn),同一組成組SNP位點(diǎn)中各SNP位點(diǎn)之間的距離使得它們的位點(diǎn)數(shù)據(jù)會(huì)出現(xiàn)在同一條測(cè)序reads上。檢測(cè)一個(gè)樣本的測(cè)序結(jié)果中每一條reads上成組SNP位點(diǎn)的基因型情況,如果存在于不同reads上的成組SNP位點(diǎn)的基因型不同,則可以判定該樣本中存在污染。