計(jì)算基因型對(duì)表型額外貢獻(xiàn)的方法及裝置
基本信息
申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201710669992.0 | 申請(qǐng)日 | - |
公開(公告)號(hào) | CN107315922B | 公開(公告)日 | 2017-11-03 |
申請(qǐng)公布號(hào) | CN107315922B | 申請(qǐng)公布日 | 2017-11-03 |
分類號(hào) | G16B20/20(2019.01)I | 分類 | - |
發(fā)明人 | 朱天生;范嘉庚;劉艷波 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人 | 杭州祥音生物醫(yī)藥科技有限公司 |
代理機(jī)構(gòu) | 北京超凡宏宇專利代理事務(wù)所(特殊普通合伙) | 代理人 | 杭州祥音醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司 |
地址 | 311200浙江省杭州市蕭山區(qū)蕭山經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)鴻興路111號(hào)5號(hào)樓4樓 | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本發(fā)明提供了計(jì)算基因型對(duì)表型額外貢獻(xiàn)的方法及裝置,涉及生物信息學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,其中,該計(jì)算基因型對(duì)表型額外貢獻(xiàn)的方法包括:首先,通過權(quán)威文獻(xiàn)及生物數(shù)據(jù)庫獲取基因多態(tài)性位點(diǎn)信息,其中,基因多態(tài)性位點(diǎn)信息包括表型、基因型、基因頻率和OR值,之后,按照基因多態(tài)性位點(diǎn)信息對(duì)應(yīng)的表型將物種細(xì)分為多個(gè)亞類,接著,根據(jù)基因頻率和OR值計(jì)算每種亞類中各個(gè)基因型的平均貢獻(xiàn)值,然后,對(duì)單個(gè)待測試物種進(jìn)行基因多態(tài)性位點(diǎn)檢測,獲取待測試物種的特定基因型,最后,根據(jù)OR值和平均貢獻(xiàn)值計(jì)算特定基因型的對(duì)表型額外貢獻(xiàn)值,通過上述方法能夠方便快捷的計(jì)算出基因型對(duì)表型的額外貢獻(xiàn)。?? |
