一種ARMS-TaqManBlocker體系的Blocker設(shè)計(jì)和篩選方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202011295178.5 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)(公告)號(hào) CN112375808A 公開(kāi)(公告)日 2021-02-19
申請(qǐng)公布號(hào) CN112375808A 申請(qǐng)公布日 2021-02-19
分類(lèi)號(hào) C12Q1/6811(2018.01)I; 分類(lèi) 生物化學(xué);啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學(xué);酶學(xué);突變或遺傳工程;
發(fā)明人 楊芳梅;徐紅梅 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 合肥歐創(chuàng)基因生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 合肥律眾知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 趙娟
地址 230000安徽省合肥市高新區(qū)創(chuàng)新大道106號(hào)明珠產(chǎn)業(yè)園3#5層D區(qū)
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開(kāi)了一種ARMS?TaqMan Blocker體系的Blocker設(shè)計(jì)和篩選方法,設(shè)計(jì)方法將Blocker設(shè)計(jì)在突變位點(diǎn)處,覆蓋突變位點(diǎn)即可;Blocker與野生型模板完全匹配,完全匹配的Tm值高于ARMS引物與野生型模板匹配的Tm值,允許熔點(diǎn)差低于5℃;Blocker與突變型模板不完全匹配,不完全匹配的Tm值與ARMS引物跟突變型模板的Tm值一致或接近;Blocker的3’末端添加多個(gè)與模板不匹配的無(wú)關(guān)堿基;篩選方法為,按照上述Blocker設(shè)計(jì)原則設(shè)計(jì)3?10條Blocker,使這些Blocker與突變型模板匹配的Tm值在ARMS引物跟突變型模板匹配的Tm值附近呈現(xiàn)逐步升高的梯度,然后經(jīng)實(shí)時(shí)PCR驗(yàn)證梯度Blocker對(duì)體系靈敏度和特異性的影響,篩選出對(duì)靈敏度無(wú)影響且特異性最好的Blocker。本發(fā)明提供的Blocker設(shè)計(jì)和篩選方法降低成本的同時(shí),提升了體系的特異性。??