一種快速檢測(cè)融合基因的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201710293318.7 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN107437002A 公開(kāi)（公告）日 2017-12-05
申請(qǐng)公布號(hào) CN107437002A 申請(qǐng)公布日 2017-12-05
分類號(hào) G06F19/22(2011.01)I 分類 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù);
發(fā)明人 閆成海;唐元華;徐健 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 首度生物科技（蘇州）有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京恒泰銘睿知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 首度生物科技（蘇州）有限公司;蘇州首度基因科技有限責(zé)任公司
地址 215123 江蘇省蘇州市蘇州工業(yè)園區(qū)星湖街218號(hào)生物納米園B8樓5層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種快速檢測(cè)融合基因的方法，包括以下步驟：A.建立融合基因數(shù)據(jù)庫(kù)：將已知的融合基因斷裂點(diǎn)以及斷裂點(diǎn)前面的N個(gè)序列和斷裂點(diǎn)后面的M個(gè)序列組成種子，種子的集合形成融合基因數(shù)據(jù)庫(kù)；B.獲取待檢測(cè)基因;D.將種子與待檢測(cè)基因的序列數(shù)據(jù)比對(duì)，確定待檢測(cè)基因的序列數(shù)據(jù)是否包含種子信息；E.當(dāng)包含待檢測(cè)基因包含種子信息時(shí)，則認(rèn)為待檢測(cè)基因內(nèi)含有融合基因；否則認(rèn)為不包含融合基因。本發(fā)明棄用了常規(guī)的融合基因?qū)ふ曳椒?，通過(guò)建立新的融合基因數(shù)據(jù)庫(kù)，采用執(zhí)果索因的方式，不需要與人類基因組進(jìn)行比較，避免了既耗時(shí)又可能產(chǎn)生錯(cuò)誤的比對(duì)基因組步驟，使得此種方法檢測(cè)速度可提高幾十倍，很少的內(nèi)存需求下完成分析,并且防止了比較錯(cuò)誤引起的誤判。