基于NGS的靶向測序數(shù)據(jù)模擬方法和裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201711498731.3 申請日 -
公開(公告)號 CN108229101B 公開(公告)日 2021-07-06
申請公布號 CN108229101B 申請公布日 2021-07-06
分類號 G16B5/00;G16B30/00 分類 物理
發(fā)明人 黨明浩;劉珂弟;張靜波;王偉偉;劉倩;唐宇 申請(專利權)人 北京科迅生物技術有限公司
代理機構 北京康信知識產權代理有限責任公司 代理人 趙囡囡
地址 100037 北京市海淀區(qū)四季青杏石口路65號益園C區(qū)C7
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于NGS的靶向測序數(shù)據(jù)模擬方法和裝置。其中,該方法包括:確定需要生成的模擬測序深度數(shù)據(jù)集所對應的多個目標區(qū)域bin,其中,模擬測序深度數(shù)據(jù)集包括多個bin中每個bin的模擬的測序深度;確定模擬測序深度數(shù)據(jù)集的期望值;生成服從以期望值為平均值、以預設方差為方差的正態(tài)分布的第一隨機數(shù),其中,預設方差為根據(jù)實際樣本預先確定的方差;生成以第一隨機數(shù)為平均值和方差的服從泊松分布的多個第二隨機數(shù);根據(jù)多個調整參數(shù)分別對多個第二隨機數(shù)進行調整,生成模擬測序深度數(shù)據(jù)集。本發(fā)明解決了現(xiàn)有技術中由于需要生成模擬的測序序列數(shù)據(jù)導致CNV檢測耗時較長,占用存儲空間大的技術問題。