基于NGS的靶向測序數(shù)據(jù)模擬方法和裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201711498731.3 申請日 -
公開(公告)號(hào) CN108229101A 公開(公告)日 2021-07-06
申請公布號(hào) CN108229101A 申請公布日 2021-07-06
分類號(hào) G06F19/20;G06F19/28 分類 計(jì)算;推算;計(jì)數(shù);
發(fā)明人 黨明浩;劉珂弟;張靜波;關(guān)永濤;王偉偉;劉倩;唐宇 申請(專利權(quán))人 北京科迅生物技術(shù)有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京康信知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 代理人 趙囡囡
地址 100037 北京市海淀區(qū)四季青杏石口路65號(hào)益園C區(qū)C7
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于NGS的靶向測序數(shù)據(jù)模擬方法和裝置。其中,該方法包括:確定需要生成的模擬測序深度數(shù)據(jù)集所對應(yīng)的多個(gè)目標(biāo)區(qū)域bin,其中,模擬測序深度數(shù)據(jù)集包括多個(gè)bin中每個(gè)bin的模擬的測序深度;確定模擬測序深度數(shù)據(jù)集的期望值;生成服從以期望值為平均值、以預(yù)設(shè)方差為方差的正態(tài)分布的第一隨機(jī)數(shù),其中,預(yù)設(shè)方差為根據(jù)實(shí)際樣本預(yù)先確定的方差;生成以第一隨機(jī)數(shù)為平均值和方差的服從泊松分布的多個(gè)第二隨機(jī)數(shù);根據(jù)多個(gè)調(diào)整參數(shù)分別對多個(gè)第二隨機(jī)數(shù)進(jìn)行調(diào)整,生成模擬測序深度數(shù)據(jù)集。本發(fā)明解決了現(xiàn)有技術(shù)中由于需要生成模擬的測序序列數(shù)據(jù)導(dǎo)致CNV檢測耗時(shí)較長,占用存儲(chǔ)空間大的技術(shù)問題。