基于超算互聯(lián)網(wǎng)的RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202210283254.3 申請日 -
公開（公告）號 CN114649052A 公開（公告）日 2022-06-21
申請公布號 CN114649052A 申請公布日 2022-06-21
分類號 G16B15/00（2019.01）I;G16B30/00（2019.01）I;G16B50/30（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 郭浩宇;楊超超;王嘉祥;王繼彬;潘景山;郭猛 申請（專利權(quán)）人 山東省計(jì)算中心（國家超級計(jì)算濟(jì)南中心）
代理機(jī)構(gòu) 濟(jì)南圣達(dá)知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 -
地址 250014山東省濟(jì)南市歷下區(qū)科院路19號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了基于超算互聯(lián)網(wǎng)的RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測方法及系統(tǒng)，包括：獲取待預(yù)測的RNA序列；對待預(yù)測的RNA序列進(jìn)行編輯；對編輯后的RNA序列，進(jìn)行RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測，得到RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果；從RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果中進(jìn)行文件提取，得到文件提取結(jié)果；基于RNA二級結(jié)構(gòu)文件提取結(jié)果和待預(yù)測的RNA序列，進(jìn)行RNA三級結(jié)構(gòu)預(yù)測，得到RNA三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果；比較RNA三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果與參考結(jié)構(gòu)之間的差異，通過多個(gè)指標(biāo)對差異進(jìn)行衡量，選擇最優(yōu)的預(yù)測結(jié)構(gòu)作為最終結(jié)構(gòu)；其中，對待預(yù)測的RNA序列進(jìn)行編輯、進(jìn)行RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測和進(jìn)行RNA三級結(jié)構(gòu)預(yù)測；均調(diào)度多個(gè)超算算力資源進(jìn)行實(shí)現(xiàn)。