一種單體聚合酶定向進化識別不同啟動子的模擬預(yù)測方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202111067042.3 申請日 -
公開（公告）號 CN113764039A 公開（公告）日 2021-12-07
申請公布號 CN113764039A 申請公布日 2021-12-07
分類號 G16B20/50（2019.01）I;G16B5/00（2019.01）I;G16B30/00（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 鄂超;戴維江;謝瀟;郭霞;楊天森;鄭善喜 申請（專利權(quán)）人 核工業(yè)湖州勘測規(guī)劃設(shè)計研究院股份有限公司
代理機構(gòu) 北京高沃律師事務(wù)所 代理人 蘇士瑩
地址 313000浙江省湖州市鳳凰路581號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種單體聚合酶定向進化識別不同啟動子的模擬預(yù)測方法，涉及生命科學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明所述方法通過使用Hdcok對得到并通過結(jié)構(gòu)比對與MD模擬篩選出最佳復(fù)合體模型、參照定向進化實驗對復(fù)合體模型進行特定突變、每個結(jié)構(gòu)執(zhí)行1μs時長的全原子分子動力學(xué)模擬和對每段軌跡進行能量計算機氫鍵鹽橋分析，得出進化路徑的能量學(xué)和結(jié)構(gòu)動力學(xué)細節(jié)。利用本發(fā)明所述方法，成功把一個噬菌體RNAP從識別其原始啟動子切換到另一個啟動子上。