一種提高宏基因組納米孔測序數(shù)據(jù)菌種組裝效率的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110927474.0 申請日 -
公開（公告）號 CN113611359A 公開（公告）日 2021-11-05
申請公布號 CN113611359A 申請公布日 2021-11-05
分類號 G16B20/20（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 李振中;陳莉;李珊;戴巖;李詩濛;任用 申請（專利權(quán)）人 江蘇先聲醫(yī)學診斷有限公司
代理機構(gòu) - 代理人 -
地址 210042江蘇省南京市玄武區(qū)玄武大道699-18號28幢
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種通過降維聚類分群提高宏基因組測序數(shù)據(jù)菌種組裝效率的方法，所述方法通過k?mer頻率或頻數(shù)統(tǒng)計，在組裝前進行降維預分群，能夠顯著提高宏基因組組裝效率，組裝時間至少減少一半以上，同時保證生信鑒定的有效性和準確性。