一種利用基因組數(shù)據(jù)探究疾病亞型親緣性的方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010469680.7 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN111653312B | 公開(kāi)（公告）日 | 2021-04-16 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN111653312B | 申請(qǐng)公布日 | 2021-04-16 |
| 分類(lèi)號(hào) | G16B20/20(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I;G16B20/50(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I | 分類(lèi) | 物理 |
| 發(fā)明人 | 侯群星;袁衛(wèi)蘭;高軍暉;林靈;吳昊天;蔣麗莎;李無(wú)霜;王瑤瑤;吳守信;許騁 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 上海寶藤生物醫(yī)藥科技股份有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京品源專(zhuān)利代理有限公司 | 代理人 | 鞏克棟 |
| 地址 | 201203上海市浦東新區(qū)中國(guó)（上海）自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)張衡路180弄3號(hào)樓5層 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供了一種利用基因組數(shù)據(jù)探究疾病亞型親緣性的方法，所述方法包括采用超幾何分布檢驗(yàn)計(jì)算基因非沉默突變富集值的步驟；所述基因非沉默突變富集值的計(jì)算公式為：其中，nf為基因在疾病亞型中發(fā)生非沉默突變的樣本數(shù)，Nf為基因在所有樣本中發(fā)生非沉默突變的樣本數(shù)，n為疾病亞型樣本數(shù)，N為樣本總數(shù)；所述疾病亞型的分組數(shù)量不小于3。本發(fā)明在進(jìn)行疾病亞型親緣性分析之前，首先利用超幾何分布檢驗(yàn)計(jì)算基因在各腫瘤亞型中的非沉默突變富集分?jǐn)?shù)，再利用此富集分?jǐn)?shù)進(jìn)行親緣性分析，減小了樣本總數(shù)、疾病亞型樣本數(shù)等背景因素對(duì)分析結(jié)果造成的影響，提高了方法的準(zhǔn)確性。?? |
