一種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法、裝置、平臺及存儲介質(zhì)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910880279.X 申請日 -
公開(公告)號 CN112530517A 公開(公告)日 2021-03-19
申請公布號 CN112530517A 申請公布日 2021-03-19
分類號 G16B45/00(2019.01)I;G16B15/00(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 郭敏;余晴;林介一;于雪 申請(專利權(quán))人 康碼芯(上海)智能科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) - 代理人 -
地址 201321上海市浦東新區(qū)芙蓉花路118弄12號樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法,包括:從待測蛋白質(zhì)文件中提取目標(biāo)序列;將目標(biāo)序列在已知結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行匹配,查找到匹配序列;根據(jù)匹配序列,獲取匹配序列的匹配結(jié)構(gòu);基于匹配序列及其匹配結(jié)構(gòu),構(gòu)建目標(biāo)序列的初始三維結(jié)構(gòu)模型;將目標(biāo)序列的未匹配序列片段結(jié)合相鄰的已匹配序列片段的一部分組合成子目標(biāo)序列;并在已知結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中查找子目標(biāo)序列的匹配子序列及其結(jié)構(gòu);根據(jù)查找到的匹配子序列及其結(jié)構(gòu),填補(bǔ)初始三維結(jié)構(gòu)模型中的缺失部分,獲得待測蛋白質(zhì)文件的三維結(jié)構(gòu)。采用本發(fā)明的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法,可以更為準(zhǔn)確地預(yù)測出蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。??