小分子藥物的細(xì)胞色素P450代謝位點(diǎn)預(yù)測方法
基本信息
申請?zhí)?/td> | CN201910631539.X | 申請日 | - |
公開(公告)號(hào) | CN110428875B | 公開(公告)日 | 2021-07-02 |
申請公布號(hào) | CN110428875B | 申請公布日 | 2021-07-02 |
分類號(hào) | G16C20/50;G16C20/70;G06N20/10;G06N3/04 | 分類 | 物理 |
發(fā)明人 | 陳萍;李遠(yuǎn)鵬;張佩宇;馬健;溫書豪;賴力鵬 | 申請(專利權(quán))人 | 深圳晶泰科技有限公司 |
代理機(jī)構(gòu) | 深圳市科吉華烽知識(shí)產(chǎn)權(quán)事務(wù)所(普通合伙) | 代理人 | 胡玉 |
地址 | 518000 廣東省深圳市福田區(qū)福保街道福保社區(qū)紅柳道2號(hào)順豐工業(yè)廠房3層 | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本發(fā)明提供一種小分子藥物的細(xì)胞色素P450代謝位點(diǎn)預(yù)測方法,采用基于支持向量機(jī)分類器的機(jī)器學(xué)習(xí)模型WhichCyp,對(duì)小分子屬于細(xì)胞色素P450酶亞型1A2,2C9,2C19,2D6及3A4中一種或幾種亞型的底物進(jìn)行預(yù)測;利用基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的機(jī)器學(xué)習(xí)模型對(duì)相應(yīng)亞型的細(xì)胞色素P450酶對(duì)小分子藥物的代謝位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測排序;對(duì)完整的細(xì)胞色素P450酶體系與完整的分子的熱力學(xué)及動(dòng)力學(xué)相互作用進(jìn)行計(jì)算評(píng)估;對(duì)各個(gè)構(gòu)象進(jìn)行較高精度的MMGBSA計(jì)算,得到不同的小分子構(gòu)象與細(xì)胞色素P450酶的結(jié)合能;利用收集到的小分子訓(xùn)練集對(duì)流程進(jìn)行訓(xùn)練,直到預(yù)測準(zhǔn)確率>80%為止。本發(fā)明提高了預(yù)測的準(zhǔn)確性。 |
