向?qū)NA作用靶點(diǎn)的篩選方法、計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)介質(zhì)及電子設(shè)備

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202111257801.2 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113990394A 公開（公告）日 2022-01-28
申請(qǐng)公布號(hào) CN113990394A 申請(qǐng)公布日 2022-01-28
分類號(hào) G16B30/10（2019.01）I;G16B20/30（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 胡楊俊;韓永紅;許曉靜 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 云舟生物科技（廣州）股份有限公司
代理機(jī)構(gòu) 廣州國鵬知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 葛紅
地址 510663 廣東省廣州市科學(xué)城掬泉路3號(hào)廣州國際企業(yè)孵化器D區(qū)D301-D309號(hào)房
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種向?qū)NA作用靶點(diǎn)的篩選方法、計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)介質(zhì)及電子設(shè)備，方法包括以下步驟：S1、從基因序列庫中獲取PAM序列；S2、將PAM序列的NGG以及PAM序列的前n個(gè)堿基取出，生成向?qū)NA；S3、將向?qū)NA與基因序列庫比對(duì)，判斷向?qū)NA的基因在基因序列庫中的位置；S4、獲取向?qū)NA中每個(gè)基因上游的m個(gè)堿基，以及對(duì)應(yīng)基因的堿基區(qū)域的向?qū)NA，在含有基因的向?qū)NA進(jìn)行打靶，剔除沒有基因的向?qū)NA；S5、剔除含有連續(xù)a個(gè)T的向?qū)NA；S6、剔除沒有在轉(zhuǎn)錄本外顯子上的向?qū)NA；S7、獲取未被剔除的向?qū)NA，篩選含有設(shè)定前綴的轉(zhuǎn)錄本的向?qū)NA；S8、獲取步驟S7得到的向?qū)NA的基因，形成具有設(shè)定前綴的轉(zhuǎn)錄本序列；S9、截取轉(zhuǎn)錄本序列中預(yù)定長度的序列。