Sanger法測(cè)序中確定單核苷酸多態(tài)性的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201910332899.X 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN110016498B 公開(kāi)（公告）日 2020-05-08
申請(qǐng)公布號(hào) CN110016498B 申請(qǐng)公布日 2020-05-08
分類號(hào) C12Q1/6869;G16B40/10 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 楊志凱;張延明;杜楠;王柏婧;張萱;朱政英;王忠杰;許志華;萬(wàn)麗君;周鑫峰 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京諾賽基因組研究中心有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京漢鼎理利專利代理事務(wù)所（特殊普通合伙） 代理人 潘滿根
地址 100176 北京市大興區(qū)北京經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)永昌北路3號(hào)1號(hào)樓1層01
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種Sanger法測(cè)序中確定單核苷酸多態(tài)性的方法，所述方法包括將來(lái)源于同一個(gè)待測(cè)序列的所述高質(zhì)量的堿基序列文件通過(guò)構(gòu)建kmer哈希表，以kmer序列為哈希表的鍵，以kmer序列在整條序列中出現(xiàn)的次數(shù)為該鍵所對(duì)應(yīng)的值，使用kmer值進(jìn)行所述高質(zhì)量堿基序列拼接組裝。本發(fā)明的Sanger法測(cè)序中確定單核苷酸多態(tài)性的方法可以實(shí)現(xiàn)全分析流程自動(dòng)化，只需設(shè)置好相關(guān)參數(shù)，中間無(wú)需人工參與，直接輸出結(jié)果文件。