使用機(jī)器學(xué)習(xí)對(duì)核酸序列進(jìn)行分類的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110378157.8 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN113096740A 公開(kāi)（公告）日 2021-07-09
申請(qǐng)公布號(hào) CN113096740A 申請(qǐng)公布日 2021-07-09
分類號(hào) G16B40/20（2019.01）I;G16B30/00（2019.01）I;G06N3/04（2006.01）I;G06N3/08（2006.01）I;G06K9/62（2006.01）I 分類 物理
發(fā)明人 趙增祥;張延明;杜楠;朱政英;王麗娜;侯全民 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京諾賽基因組研究中心有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京漢鼎理利專利代理事務(wù)所（特殊普通合伙） 代理人 潘滿根
地址 100176北京市大興區(qū)北京經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)永昌北路3號(hào)1號(hào)樓1層01
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種使用機(jī)器學(xué)習(xí)對(duì)核酸序列進(jìn)行分類的方法，所述方法包括收集帶有準(zhǔn)確分類標(biāo)簽的核酸序列構(gòu)建核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)，將核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)中所有核酸序列分割成等長(zhǎng)度的短序列，從而形成短核酸序列均衡樣本；提取核酸Kmer，形成核酸序列的Kmer字典；使用Kmer字典將短核酸序列均衡樣本轉(zhuǎn)化成數(shù)字信號(hào)；使用數(shù)字信號(hào)訓(xùn)練一個(gè)能對(duì)帶有分類標(biāo)簽的核酸序列進(jìn)行多分類的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類器；使用Kmer字典將待檢測(cè)核酸序列轉(zhuǎn)化成數(shù)字信號(hào)；然后將數(shù)字信號(hào)輸入到訓(xùn)練好的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類器中，對(duì)待檢測(cè)核酸序列進(jìn)行分類。通過(guò)本發(fā)明的方法，能夠準(zhǔn)確快速地將待檢測(cè)核酸序列與構(gòu)建數(shù)據(jù)庫(kù)中核酸序列的標(biāo)簽進(jìn)行對(duì)應(yīng)分類，并展示每個(gè)標(biāo)簽的可靠性分值，為后續(xù)研究提供參考，增加了模型的使用價(jià)值。