Sanger法測序中確定單核苷酸多態(tài)性的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910332899.X 申請日 -
公開（公告）號 CN110016498A 公開（公告）日 2019-07-16
申請公布號 CN110016498A 申請公布日 2019-07-16
分類號 C12Q1/6869;G16B40/10 分類 生物化學；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學；酶學；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 楊志凱;張延明;杜楠;王柏婧;張萱;朱政英;王忠杰;許志華;萬麗君;周鑫峰 申請（專利權）人 北京諾賽基因組研究中心有限公司
代理機構 北京漢鼎理利專利代理事務所（特殊普通合伙） 代理人 潘滿根
地址 100176 北京市大興區(qū)北京經(jīng)濟技術開發(fā)區(qū)永昌北路3號1號樓1層01
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種Sanger法測序中確定單核苷酸多態(tài)性的方法，所述方法包括將來源于同一個待測序列的所述高質(zhì)量的堿基序列文件通過構建kmer哈希表，以kmer序列為哈希表的鍵，以kmer序列在整條序列中出現(xiàn)的次數(shù)為該鍵所對應的值，使用kmer值進行所述高質(zhì)量堿基序列拼接組裝。本發(fā)明的Sanger法測序中確定單核苷酸多態(tài)性的方法可以實現(xiàn)全分析流程自動化，只需設置好相關參數(shù)，中間無需人工參與，直接輸出結果文件。