雙層互強(qiáng)化的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202110626528.X | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN113223608A | 公開(kāi)（公告）日 | 2021-08-06 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN113223608A | 申請(qǐng)公布日 | 2021-08-06 |
| 分類(lèi)號(hào) | G16B15/20;G16B40/00;G16B50/30;G06F16/2455;G06N3/04;G06N3/08 | 分類(lèi) | 物理 |
| 發(fā)明人 | 苗洪江;湯一珂;沈邱難;薛貴榮 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 上海天壤智能科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 上海段和段律師事務(wù)所 | 代理人 | 黃磊;郭國(guó)中 |
| 地址 | 201100 上海市閔行區(qū)劍川路951號(hào)5幢1層（集中登記地） | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供了一種雙層互強(qiáng)化的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)，包括：獲取蘊(yùn)含蛋白質(zhì)共進(jìn)化信息的多序列排列矩陣以及蛋白質(zhì)模版，并分別轉(zhuǎn)化成嵌入向量，輸入到基于注意力機(jī)制的多頭神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)；通過(guò)在序列邊和殘基邊分別進(jìn)行并互相更新的方式提取蛋白質(zhì)中每對(duì)氨基酸序列的相互作用關(guān)系；多頭神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的一個(gè)頭輸出每對(duì)兒氨基酸殘基間距離的概率分布，另一個(gè)頭輸出每個(gè)氨基酸殘基扭轉(zhuǎn)角的角度概率分布；根據(jù)輸出的每對(duì)兒氨基酸殘基間距離的概率分布和每個(gè)氨基酸殘基扭轉(zhuǎn)角的角度概率分布，通過(guò)梯度下降法得到最符合的預(yù)測(cè)距離/角度的三維結(jié)構(gòu)作為預(yù)測(cè)結(jié)果。本發(fā)明能夠讓網(wǎng)絡(luò)能夠更加均衡地提取全局化信息，從而更準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)整體三維結(jié)構(gòu)。 |
