一種PCR引物設(shè)計(jì)模板篩選的方法及應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202011517283.9 申請日 -
公開（公告）號 CN112634990A 公開（公告）日 2021-04-09
申請公布號 CN112634990A 申請公布日 2021-04-09
分類號 G16B25/20;G16B30/10;G16B20/20;C12Q1/70;C12Q1/686;C12Q1/6811 分類 物理
發(fā)明人 黃曉強(qiáng);蒙裕歡;歐小華;繆夏萍;李桂彬;范喜杰;嚴(yán)慧;于世輝 申請（專利權(quán)）人 廣州市金域轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究院有限公司
代理機(jī)構(gòu) 廣州新諾專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 代理人 李海恬;沈芳
地址 510000 廣東省廣州市國際生物島螺旋三路10號南樓319房
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種PCR引物設(shè)計(jì)模板篩選的方法及應(yīng)用，涉及分子生物學(xué)檢測技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明的方法包括：從數(shù)據(jù)庫獲取目標(biāo)種屬的基因組，所述基因組中包括已知的變異株的基因組序列，進(jìn)行多序列全局對比并分析基因組變異；根據(jù)目標(biāo)種屬基因組比對文件，確定基因組中的高度保守序列；計(jì)算高度保守序列的GC％與堿基隨機(jī)性；以高度保守序列的GC％與堿基隨機(jī)性作為篩選參數(shù)，對高度保守序列的引物設(shè)計(jì)模板進(jìn)行篩選。該方法可系統(tǒng)高效地篩選PCR引物設(shè)計(jì)模板，采用該模板設(shè)計(jì)得到的PCR引物具有高特異性和高效率的特點(diǎn)。