針對16SrDNA鑒定的一代測序數(shù)據(jù)拼接方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202210020674.2 申請日 -
公開（公告）號 CN114512190A 公開（公告）日 2022-05-17
申請公布號 CN114512190A 申請公布日 2022-05-17
分類號 G16B30/10（2019.01）I;G16B50/30（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 王美霞;李宏;車陽;孫曉飛;陶津;洪文杰;王煥英;王庭璋 申請（專利權）人 浙江天科高新技術發(fā)展有限公司
代理機構 杭州求是專利事務所有限公司 代理人 -
地址 310012浙江省杭州市黃姑山路9號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種針對16S rDNA鑒定的一代測序數(shù)據(jù)拼接方法。包括：建立基于比對模塊和拼接模塊的序列拼接程序，實現(xiàn)對一代測序下機待分析序列數(shù)據(jù)的拼接，輸出可用于后續(xù)鑒定分析的完整序列；比對模塊包括比對模型，打分標準和優(yōu)選標準；比對模型使用一個方向進行打分計算和回溯；打分標準引入了簡并堿基的概念，將4個堿基擴展到15個堿基，包括A、T、C、G、R、Y、M、K、S、W、H、B、V、D、N；其中，完全相同的堿基、簡并堿基包含正常堿基時打分為10分，任意堿基比對N為1分，任意堿基比對“?”為2分，相同位點兩個堿基不同為2分。本發(fā)明建立了全新的序列拼接的核心思想，具有速度快、運算量小、準確率高等優(yōu)點。