一種細(xì)菌DNA序列快速注釋方法及裝置
基本信息
| 申請?zhí)?/td> | CN202010795329.7 | 申請日 | - |
| 公開（公告）號 | CN112017729A | 公開（公告）日 | 2020-12-01 |
| 申請公布號 | CN112017729A | 申請公布日 | 2020-12-01 |
| 分類號 | G16B20/30(2019.01)I;G16B30/00(2019.01)I | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 華孝挺;俞云松;陳歡;梁倩;洪文杰;何錦濤;張玲虹 | 申請（專利權(quán)）人 | 浙江天科高新技術(shù)發(fā)展有限公司 |
| 代理機構(gòu) | 杭州求是專利事務(wù)所有限公司 | 代理人 | 應(yīng)孔月 |
| 地址 | 310058浙江省杭州市西湖區(qū)余杭塘路866號 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開了一種細(xì)菌DNA序列快速注釋方法及裝置，該方法分別構(gòu)建ResDB、ISDB、IntegronDB和TransposonDB數(shù)據(jù)庫；獲取待分析的細(xì)菌DNA序列；利用BLASTN程序?qū)⒋治龅募?xì)菌DNA序列與ResDB、ISDB、IntegronDB和TransposonDB數(shù)據(jù)庫中的一個或多個進(jìn)行比對；根據(jù)比對的覆蓋率和一致性，獲得最佳匹配基因和最佳匹配基因?qū)?yīng)的查詢基因的比對片段序列信息，并輸出注釋結(jié)果。該方法將有助于簡化和優(yōu)化目前的基因組分析流程，加快后續(xù)的基因組分析。?? |
