FFPE樣本建庫的方法及其應用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110506226.9 申請日 -
公開（公告）號 CN113005525A 公開（公告）日 2021-06-22
申請公布號 CN113005525A 申請公布日 2021-06-22
分類號 C40B50/06;C40B40/06;C12Q1/6869 分類 組合技術(shù)〔8〕;
發(fā)明人 胡玉剛;汪彪;鄭文莉;吳強 申請（專利權(quán)）人 納昂達（南京）生物科技有限公司
代理機構(gòu) 北京康信知識產(chǎn)權(quán)代理有限責任公司 代理人 路秀麗
地址 210000 江蘇省南京市江北新區(qū)華康路142號南京生物醫(yī)藥谷加速器三期A01棟南側(cè)3-4層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種FFPE建庫的方法及其應用。該方法包括：通過利用內(nèi)切酶進行酶切片段化，對片段化DNA依次進行末端修復加A及接頭連接，對連上接頭的DNA片段進行PCR擴增，得到測序文庫，其中內(nèi)切酶具有如下功能：a）在DNA缺口處切割；b）保留雙鏈末端突出堿基部分。由于FFPE在固定的過程中和固定之前都有帶來降級和部分堿基的脫落，該方法充分利用FFPE的本身的缺口問題，能夠在缺口處斷裂DNA片段的酶打斷DNA后結(jié)合正常的補平加A、連接接頭和PCR擴增的方式進行建庫，解決了由于FFPE本身的損傷和打斷損傷不兼容導致的建庫效率低的問題，從而解決了降解比較嚴重的樣本難以建庫的問題。