在RNA建庫過程中封閉核糖體RNA或球蛋白RNA的探針及其應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202111216082.X 申請日 -
公開（公告）號 CN113862334A 公開（公告）日 2021-12-31
申請公布號 CN113862334A 申請公布日 2021-12-31
分類號 C12Q1/6806（2018.01）I;C12N15/11（2006.01）I;C40B50/06（2006.01）I 分類 生物化學；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學；酶學；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 宋東亮;江翱;曹振;陳晶晶;侯策;王嫚;劉倩 申請（專利權(quán)）人 翌圣生物科技（上海）股份有限公司
代理機構(gòu) 蘇州根號專利代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 朱華慶
地址 200120上海市浦東新區(qū)天雄路166弄1號樓402室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種在RNA建庫過程中封閉核糖體RNA或球蛋白RNA的探針，探針長度為35?60 nt，探針與核糖體RNA或球蛋白RNA通過互補配對形成三元封閉復合物。探針的后半?yún)^(qū)域與靶RNA嚴格互補配對，探針配對區(qū)域的5’端5?9個堿基被修飾堿基代替；探針的前半?yún)^(qū)域是嘧啶堿基，用于嵌合到DNA/RNA雙鏈的大溝中形成三元復合物。探針的3’?OH利用MGB進行封閉，用于防止探針作為引物進行延伸；同時MGB可嵌合到DNA/RNA雙鏈的小溝，提高三元復合物的穩(wěn)定性。并公開了其在RNA建庫中快速去除核糖體RNA或球蛋白RNA的應(yīng)用。本發(fā)明具有操作簡單、耗時極短、特異性強、適用性廣、去除效率高和基因檢出數(shù)高等優(yōu)點，適合用于工業(yè)自動化建庫和疾病快速診斷領(lǐng)域。