人類(lèi)短片段串聯(lián)重復(fù)序列高通量測(cè)序信息的處理方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201610102496.2 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN107122625B | 公開(kāi)（公告）日 | 2017-09-01 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN107122625B | 申請(qǐng)公布日 | 2017-09-01 |
| 分類(lèi)號(hào) | G16B20/20(2019.01)I | 分類(lèi) | 物理 |
| 發(fā)明人 | 周騁;姚旭斌;潘雅姣 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 北京愛(ài)普益生物科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京圣州專(zhuān)利代理事務(wù)所（普通合伙） | 代理人 | 北京愛(ài)普益生物科技有限公司 |
| 地址 | 100176北京市大興區(qū)經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)地盛東路1號(hào)愛(ài)普益大廈5層 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開(kāi)了人類(lèi)短片段串聯(lián)重復(fù)序列高通量測(cè)序信息的處理方法，屬于生物檢測(cè)領(lǐng)域。該方法為：保留單張芯片的STR高通量測(cè)序信息中具有預(yù)設(shè)測(cè)序長(zhǎng)度的序列，形成第一序列；根據(jù)樣本標(biāo)簽信息，將第一序列分類(lèi)至不同樣本文件夾中，根據(jù)STR目的片段特異引物信息，將第一序列再分類(lèi)至不同STR基因座文件夾中，形成第二序列；建立針對(duì)不同STR基因座的階梯參比序列，將第二序列與其中相應(yīng)STR基因座的序列比對(duì)，保留序列相似度≥90％的第三序列；將樣本測(cè)序條目數(shù)的閾值設(shè)為1000，將基因座測(cè)序條目數(shù)的閾值設(shè)為50，將基因座內(nèi)分型測(cè)序條目數(shù)的閾值設(shè)為5，將基因座內(nèi)分型測(cè)序條目數(shù)/基因座測(cè)序條目數(shù)的閾值設(shè)為40％，篩選第三序列中≥以上閾值的序列，得STR分型結(jié)果。?? |
