一種融合網(wǎng)絡(luò)拓撲信息的化合物-蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202210491027.X 申請日 -
公開（公告）號 CN114678081A 公開（公告）日 2022-06-28
申請公布號 CN114678081A 申請公布日 2022-06-28
分類號 G16C20/30（2019.01）I;G16B25/00（2019.01）I;G06K9/62（2022.01）I 分類 物理
發(fā)明人 劉宏生;于笑雪;張力;徐鑫 申請（專利權(quán)）人 遼寧大學(xué)
代理機構(gòu) 沈陽杰克知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 -
地址 110000遼寧省沈陽市沈北新區(qū)道義南大街58號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及一種融合網(wǎng)絡(luò)拓撲信息的化合物?蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測方法，包括以下步驟：步驟1：數(shù)據(jù)預(yù)處理；步驟2：構(gòu)建相互作用網(wǎng)絡(luò)，計算網(wǎng)絡(luò)中每個節(jié)點的中心性度量；步驟3：對于數(shù)據(jù)集中每對化合物和蛋白質(zhì)，使用基于共同鄰居數(shù)的方法，計算化合物與蛋白質(zhì)的相關(guān)性度量；步驟4：構(gòu)建一個基于transformer的模型，將節(jié)點的中心性加到節(jié)點特征中。步驟5：將每對節(jié)點的相關(guān)性作為交叉注意模塊中的偏置項。步驟6：利用全連接層輸出預(yù)測概率。本發(fā)明考慮到了相互作用網(wǎng)絡(luò)中的拓撲信息，將蛋白質(zhì)和化合物本身的性質(zhì)與相互作用網(wǎng)絡(luò)的拓撲信息融合，有效地利用拓撲信息提高了化合物?蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測的準確率。