一種融合網(wǎng)絡(luò)拓?fù)湫畔⒌幕衔?蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測(cè)方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202210491027.X 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN114678081A 公開（公告）日 2022-06-28
申請(qǐng)公布號(hào) CN114678081A 申請(qǐng)公布日 2022-06-28
分類號(hào) G16C20/30（2019.01）I;G16B25/00（2019.01）I;G06K9/62（2022.01）I 分類 物理
發(fā)明人 劉宏生;于笑雪;張力;徐鑫 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 遼寧大學(xué)
代理機(jī)構(gòu) 沈陽杰克知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 -
地址 110000遼寧省沈陽市沈北新區(qū)道義南大街58號(hào)
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及一種融合網(wǎng)絡(luò)拓?fù)湫畔⒌幕衔?蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測(cè)方法，包括以下步驟：步驟1：數(shù)據(jù)預(yù)處理；步驟2：構(gòu)建相互作用網(wǎng)絡(luò)，計(jì)算網(wǎng)絡(luò)中每個(gè)節(jié)點(diǎn)的中心性度量；步驟3：對(duì)于數(shù)據(jù)集中每對(duì)化合物和蛋白質(zhì)，使用基于共同鄰居數(shù)的方法，計(jì)算化合物與蛋白質(zhì)的相關(guān)性度量；步驟4：構(gòu)建一個(gè)基于transformer的模型，將節(jié)點(diǎn)的中心性加到節(jié)點(diǎn)特征中。步驟5：將每對(duì)節(jié)點(diǎn)的相關(guān)性作為交叉注意模塊中的偏置項(xiàng)。步驟6：利用全連接層輸出預(yù)測(cè)概率。本發(fā)明考慮到了相互作用網(wǎng)絡(luò)中的拓?fù)湫畔?，將蛋白質(zhì)和化合物本身的性質(zhì)與相互作用網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)湫畔⑷诤希行У乩猛負(fù)湫畔⑻岣吡嘶衔?蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確率。