基因測(cè)序數(shù)據(jù)讀取方法及系統(tǒng)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201210592061.2 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)(公告)號(hào) CN103049680B 公開(kāi)(公告)日 2016-09-07
申請(qǐng)公布號(hào) CN103049680B 申請(qǐng)公布日 2016-09-07
分類(lèi)號(hào) G06F19/20;G06F17/21 分類(lèi) 計(jì)算;推算;計(jì)數(shù);
發(fā)明人 孟金濤;魏延杰;成杰峰;馮圣中 申請(qǐng)(專利權(quán))人 深圳市弘志拓新創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)(有限合伙)
代理機(jī)構(gòu) 深圳市科進(jìn)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 代理人 宋鷹武
地址 518055 廣東省深圳市南山區(qū)西麗大學(xué)城學(xué)苑大道1068號(hào)
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及生物信息學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,提出了一種基因測(cè)序數(shù)據(jù)讀取方法,包括如下步驟:對(duì)用戶參數(shù)進(jìn)行解析,確定任務(wù)個(gè)數(shù);根據(jù)任務(wù)個(gè)數(shù)將測(cè)序數(shù)據(jù)分割成相同大小的文件塊;對(duì)每個(gè)文件塊的起始地址和終止地址進(jìn)行調(diào)整;各任務(wù)對(duì)調(diào)整后的文件塊結(jié)果進(jìn)行讀取。本發(fā)明還提供了基因測(cè)序數(shù)據(jù)讀取系統(tǒng)及設(shè)有所述系統(tǒng)的基因測(cè)序數(shù)據(jù)分析裝置。本發(fā)明實(shí)現(xiàn)了基因測(cè)序數(shù)據(jù)的并行讀取,且各個(gè)文件塊大小均勻,還避免了將一個(gè)序列分割到兩個(gè)不同的文件塊中。