基于耐受性分析的基因等級排序方法和裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910156462.5 申請日 -
公開(公告)號 CN109949868A 公開(公告)日 2019-06-28
申請公布號 CN109949868A 申請公布日 2019-06-28
分類號 G16B30/10(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 藍章彰; 楊傳春; 陳川; 張麗娟; 張亞琦; 崔孝禮; 韓菲菲; 丁利杰; 李沛; 汪凱 申請(專利權(quán))人 深圳樂土生物科技有限公司
代理機構(gòu) 深圳鼎合誠知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 孫銀行;彭家恩
地址 518000 廣東省深圳市大鵬新區(qū)葵涌街道生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)園A11棟201
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 一種基于耐受性分析的基因等級排序方法和裝置,該方法包括:獲取頻率數(shù)據(jù)庫和轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù);從轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫獲取各個基因的轉(zhuǎn)錄本作為編碼序列數(shù)據(jù);從頻率數(shù)據(jù)庫中提取目標基因序列;將編碼序列數(shù)據(jù)映射到目標基因序列,檢測得到目標基因序列上的功能性突變和非功能性突變;選取功能性突變和非功能性突變中等位基因頻率在第三預(yù)設(shè)值以下的突變作為基因等級排序的分析對象;對分析對象建立基因等級排序表,得到多個不同基因的基因等級分數(shù),以此表征該基因的耐受性。本發(fā)明以基因為單位,利用功能基因?qū)膊〉哪褪苄?,建立基因等級排序,在功能基因的預(yù)測上具有較高的可信度和準確性。