一種基于HPV整合的腫瘤新抗原預測方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110696080.9 申請日 -
公開（公告）號 CN113362896A 公開（公告）日 2021-09-07
申請公布號 CN113362896A 申請公布日 2021-09-07
分類號 G16B25/10;G16B30/00;C12Q1/6869 分類 物理
發(fā)明人 萬季;劉鵬;沈一鳴;潘有東;王弈 申請（專利權(quán)）人 深圳市新合生物醫(yī)療科技有限公司
代理機構(gòu) 北京冠和權(quán)律師事務(wù)所 代理人 趙銀萍
地址 518055 廣東省深圳市南山區(qū)桃源街道留仙大道眾創(chuàng)產(chǎn)業(yè)園B50棟4層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于HPV整合的腫瘤新抗原預測方法，屬于生物信息學技術(shù)領(lǐng)域。該方法包括以下步驟：S01，組裝腫瘤樣品轉(zhuǎn)錄本；S02，篩選樣本HPV整合轉(zhuǎn)錄本；S03，翻譯HPV整合轉(zhuǎn)錄本為多肽；S04，獲取多肽短序列片段，并過濾人類正常蛋白質(zhì)組中多肽；S05，樣品人類白細胞抗原基因分型；S06，肽段親和力預測、新抗原篩選。本發(fā)明得到的新抗原是HPV整合的結(jié)果，與疾病進展過程密切相關(guān)。本發(fā)明得到的新抗原來自于RNA測序數(shù)據(jù)，是細胞轉(zhuǎn)錄的結(jié)果，有更高的概率翻譯產(chǎn)生蛋白質(zhì)。