一種計算腫瘤新抗原負荷的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202011098269.X 申請日 -
公開（公告）號 CN112309502A 公開（公告）日 2021-02-02
申請公布號 CN112309502A 申請公布日 2021-02-02
分類號 G16B30/10(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 萬季;沈一鳴;汪健;潘有東;王弈;宋麒 申請（專利權）人 深圳市新合生物醫(yī)療科技有限公司
代理機構 北京冠和權律師事務所 代理人 田鴻儒
地址 518055廣東省深圳市南山區(qū)桃源街道留仙大道眾創(chuàng)產(chǎn)業(yè)園B50棟4層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種計算腫瘤新抗原負荷的方法及系統(tǒng)，其中方法包括：步驟S1：整合樣本正常及腫瘤數(shù)據(jù)，對特定區(qū)間進行測序并檢測樣本的體細胞突變；步驟S2：對體細胞突變進行注釋過濾，并進行翻譯得到患者的突變多肽序列；步驟S3：根據(jù)樣本正常蛋白質組，過濾突變多肽序列，得到新多肽序列；步驟S4：根據(jù)樣本正常比對數(shù)據(jù)進行人類白細胞抗原分型分析，得到樣本的HLA基因型；本發(fā)明的計算腫瘤新抗原負荷的方法，對每一個預測的新抗原進行權重打分，考慮到突變質量、突變頻率以及親和力高低等不同維度信息，能夠區(qū)別高質量和低質量的新抗原，從而得到一個更能反應樣本真實腫瘤新抗原負荷的數(shù)值。??