消除常染色體內(nèi)和染色體間GC偏好的方法及檢測(cè)系統(tǒng)
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201510009648.X | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN105825076B | 公開(kāi)（公告）日 | 2018-12-14 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN105825076B | 申請(qǐng)公布日 | 2018-12-14 |
| 分類(lèi)號(hào) | G06F19/18 | 分類(lèi) | 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù); |
| 發(fā)明人 | 牟曉威;陳幗婧;屠勇軍;陳賢豐 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 杭州天譯基因科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京世譽(yù)鑫誠(chéng)專(zhuān)利代理事務(wù)所（普通合伙） | 代理人 | 杭州天譯基因科技有限公司 |
| 地址 | 310015 浙江省杭州市拱墅區(qū)余杭塘路478號(hào)2幢1209室 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開(kāi)了一種消除常染色體內(nèi)和染色體間GC偏好的方法及檢測(cè)系統(tǒng)，該檢測(cè)系統(tǒng)包括：(1)用于通過(guò)高通量測(cè)序獲得樣本全基因組序列的高通量測(cè)序儀；(2)用于執(zhí)行以下步驟的多條指令的計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，包括：a、用于構(gòu)建一種消除GC偏差的系統(tǒng)，b、用于構(gòu)建另一種消除GC偏差的系統(tǒng)，c、用于構(gòu)建檢測(cè)樣本中非整倍體與正常樣本的檢測(cè)系統(tǒng)。最終根據(jù)兩種不同矯正獲得的Z值判斷是否為非整倍體。采用本發(fā)明的檢測(cè)系統(tǒng)，去除GC偏差，在避免數(shù)據(jù)的失真的同時(shí)還獲得更高敏感性的胎兒遺傳異常檢測(cè)。本發(fā)明的檢測(cè)系統(tǒng)根據(jù)GC含量定義用于統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的參數(shù)。另外，通過(guò)Z值統(tǒng)計(jì)的方法根據(jù)大批量的數(shù)據(jù)得出統(tǒng)計(jì)意義上的參數(shù)，從而得到更高的精確度。 |
