一種利用宏基因組或宏轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)微生物的分析方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201910537997.7 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN110349629B | 公開(kāi)（公告）日 | 2021-08-06 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN110349629B | 申請(qǐng)公布日 | 2021-08-06 |
| 分類號(hào) | G16B30/10;G16B40/00 | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 龔浩;何雪瑩;余旻斐;陳杰 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 廣州賽哲生物科技股份有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 廣州粵高專利商標(biāo)代理有限公司 | 代理人 | 段卉 |
| 地址 | 410006 湖南省長(zhǎng)沙市岳麓區(qū)學(xué)士街道學(xué)士路336號(hào) | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開(kāi)了一種利用宏基因組或宏轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)微生物的分析方法。所述分析方法對(duì)測(cè)序下機(jī)數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)質(zhì)控，過(guò)濾后得到高質(zhì)量數(shù)據(jù)，然后并行進(jìn)行組裝和雙端拼接(單端則不拼接)，組裝和拼接所得數(shù)據(jù)基于bwa算法比對(duì)到微生物參考數(shù)據(jù)庫(kù)，鑒定樣本內(nèi)微生物物種及其豐度信息。過(guò)濾低質(zhì)量結(jié)果后整合分析結(jié)果。本發(fā)明方法適用范圍廣，能檢測(cè)多種類型微生物，兼容多種主流測(cè)序平臺(tái)，兼顧單端、雙端測(cè)序數(shù)據(jù)及長(zhǎng)讀長(zhǎng)、短讀長(zhǎng)序列數(shù)據(jù)特點(diǎn)，可從各類型測(cè)序數(shù)據(jù)準(zhǔn)確地分析樣本內(nèi)微生物物種及其豐度。本發(fā)明方法能夠有效降低假陽(yáng)性，克服大部分微生物無(wú)法培養(yǎng)的難點(diǎn)，準(zhǔn)確、快速、全面檢測(cè)各類型樣本內(nèi)微生物。 |
