一種基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和連接圖算法的化合物功能預(yù)測方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110463817.2 申請日 -
公開（公告）號 CN113178234A 公開（公告）日 2021-07-27
申請公布號 CN113178234A 申請公布日 2021-07-27
分類號 G16C20/30;G16C20/70;G16C20/50;G06N3/04;G06N3/08 分類 物理
發(fā)明人 謝正偉;朱杰;王靖翔;高明景;劉祖瑞 申請（專利權(quán)）人 北京億藥科技有限公司
代理機構(gòu) 南京中律知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 沈振濤
地址 100000 北京市昌平區(qū)回龍觀東大街338號創(chuàng)客廣場A1-06-420
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和連接圖算法的化合物功能預(yù)測方法，或稱化合物藥效預(yù)測方法，包括以下步驟：構(gòu)建化合物分子?編碼向量神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)；構(gòu)建并訓(xùn)練編碼向量?標記基因表達量變化深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)；構(gòu)建并訓(xùn)練標記基因表達量或者表達變化量映射至全基因組基因表達量或基因表達變化量神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)；構(gòu)建疾病或者表型的上調(diào)和下調(diào)基因集合；評價化合物對疾病或表型的相互關(guān)系。本發(fā)明提供的化合物功能預(yù)測方法是基于基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和連接圖算法提出的，可在藥物研發(fā)前期實現(xiàn)高通量的預(yù)測化合物對細胞內(nèi)基因表達變化的方法，并可根據(jù)基因表達變化對化合物功能和副作用進行預(yù)測，從而可大大加速藥物研發(fā)進程。