無(wú)參考基因組序列的轉(zhuǎn)錄組分析方法及系統(tǒng)
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202011255655.5 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN112397149A | 公開(kāi)（公告）日 | 2021-02-23 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112397149A | 申請(qǐng)公布日 | 2021-02-23 |
| 分類號(hào) | G16B30/10(2019.01)I; | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 田振陽(yáng);王蘋 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 天津現(xiàn)代創(chuàng)新中藥科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京康信知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 | 代理人 | 路秀麗 |
| 地址 | 300142天津市西青區(qū)海泰發(fā)展六道綠色產(chǎn)業(yè)基地2期M1座 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供了一種無(wú)參考基因組序列的轉(zhuǎn)錄組分析方法及系統(tǒng)。該分析方法包括：獲取待測(cè)樣本的二代RNA有效測(cè)序數(shù)據(jù)和三代RNA有效測(cè)序數(shù)據(jù)；利用二代RNA有效測(cè)序數(shù)據(jù)對(duì)三代RNA有效測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行校正；對(duì)三代校正后的有效數(shù)據(jù)進(jìn)行去冗余獲得unigene序列；將二代RNA有效測(cè)序數(shù)據(jù)與unigene序列進(jìn)行序列比對(duì)，利用比對(duì)文件，對(duì)每個(gè)unigene序列上的reads數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，獲得每個(gè)基因的表達(dá)水平FPKM值。該分析方法整合了二代和三代測(cè)序技術(shù)的優(yōu)勢(shì)，解決了目前尚無(wú)利用三代測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行對(duì)無(wú)參考基因組序列的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析的問(wèn)題。?? |
