無參考基因組序列的轉錄組分析方法及系統(tǒng)
基本信息
| 申請?zhí)?/td> | CN202011255655.5 | 申請日 | - |
| 公開（公告）號 | CN112397149A | 公開（公告）日 | 2021-02-23 |
| 申請公布號 | CN112397149A | 申請公布日 | 2021-02-23 |
| 分類號 | G16B30/10(2019.01)I; | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 田振陽;王蘋 | 申請（專利權）人 | 天津現(xiàn)代創(chuàng)新中藥科技有限公司 |
| 代理機構 | 北京康信知識產(chǎn)權代理有限責任公司 | 代理人 | 路秀麗 |
| 地址 | 300142天津市西青區(qū)海泰發(fā)展六道綠色產(chǎn)業(yè)基地2期M1座 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供了一種無參考基因組序列的轉錄組分析方法及系統(tǒng)。該分析方法包括：獲取待測樣本的二代RNA有效測序數(shù)據(jù)和三代RNA有效測序數(shù)據(jù)；利用二代RNA有效測序數(shù)據(jù)對三代RNA有效測序數(shù)據(jù)進行校正；對三代校正后的有效數(shù)據(jù)進行去冗余獲得unigene序列；將二代RNA有效測序數(shù)據(jù)與unigene序列進行序列比對，利用比對文件，對每個unigene序列上的reads數(shù)進行統(tǒng)計，獲得每個基因的表達水平FPKM值。該分析方法整合了二代和三代測序技術的優(yōu)勢，解決了目前尚無利用三代測序數(shù)據(jù)進行對無參考基因組序列的轉錄組進行分析的問題。?? |
