病原微生物宏基因組生信分析參考品及其制備方法和應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202210392556.4 申請日 -
公開（公告）號 CN114496085B 公開（公告）日 2022-07-05
申請公布號 CN114496085B 申請公布日 2022-07-05
分類號 G16B30/00（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;G16B50/00（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 楊啟文;朱盈;賈沛瑤;喻瑋;楊斌;劉慧芳;韓士瑞 申請（專利權(quán)）人 廣州微遠(yuǎn)基因科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 廣州新諾專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 代理人 -
地址 100032北京市東城區(qū)王府井帥府園1號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及一種病原微生物宏基因組生信分析參考品及其制備方法和應(yīng)用，屬于基因檢測技術(shù)領(lǐng)域。該方法包括以下步驟：建立豐度分布模型：收集臨床樣本的宏基因組檢測數(shù)據(jù)，建立自變量為測序序列數(shù)目因變量為相對豐度的高斯回歸模型；標(biāo)準(zhǔn)化高通量測序數(shù)據(jù)生成：獲取參考基因組序列，模擬生成每種微生物物種預(yù)定讀長和預(yù)定測序錯誤率的高通量序列數(shù)據(jù)；Gamma?泊松分布模型：以Gamma?泊松分布模型擬合臨床樣本的宏基因組檢測數(shù)據(jù)；參考品制備：以Gamma?泊松分布模型隨機(jī)產(chǎn)生一組模擬樣本序列數(shù)據(jù)，并從標(biāo)準(zhǔn)化高通量測序數(shù)據(jù)中隨機(jī)挑選相同數(shù)目的測序數(shù)據(jù)，即得。采用該方法得到的生信分析參考品，可全面地評估生物信息分析流程的靈敏度、特異度、召回率和準(zhǔn)確性。