病原微生物分析鑒定系統(tǒng)及應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010281509.3 申請日 -
公開(公告)號 CN111462821A 公開(公告)日 2020-07-28
申請公布號 CN111462821A 申請公布日 2020-07-28
分類號 G16B30/00(2019.01)I 分類 -
發(fā)明人 許騰;陳文景;張麗珍;劉足;潘秀瑩;曾偉奇;秦璐;李永軍;王小銳;蘇杭 申請(專利權(quán))人 廣州微遠基因科技有限公司
代理機構(gòu) 廣州新諾專利商標事務(wù)所有限公司 代理人 廣州微遠基因科技有限公司;廣州微遠醫(yī)療器械有限公司;廣州微遠醫(yī)學檢驗實驗室有限公司;深圳微遠醫(yī)療科技有限公司
地址 510130廣東省廣州市高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)科豐路31號自編三棟華南新材料創(chuàng)新園G10棟303號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及一種病原微生物分析鑒定系統(tǒng)及應(yīng)用,屬于基因檢測分析技術(shù)領(lǐng)域。該病原微生物分析鑒定系統(tǒng)包括:數(shù)據(jù)獲取模塊:用于獲取高通量測序得到的基因測序數(shù)據(jù);數(shù)據(jù)過濾模塊:用于將依次進行低質(zhì)量序列過濾、宿主序列過濾;數(shù)據(jù)比對模塊:用于將序列比對至病原微生物基因組數(shù)據(jù)庫中;物種比對模塊:用于統(tǒng)計待分析序列;數(shù)據(jù)分析模塊:用于計算共有比對序列集中各序列對比上每一個物種的相似度S和平均相似度值SMSi;物種序列模塊:用于計算物種的總比對序列數(shù)SNTi;結(jié)果輸出模塊:用于進行生物信息學分析,得到病原微生物分析鑒定結(jié)果。該病原微生物分析鑒定系統(tǒng)不僅具有分析時間短、準確性高的優(yōu)點;還可準確得檢測混合感染,獲得具體病原體信息。??