多倍體基因組同源染色體的拆分方法、裝置及其應(yīng)用
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | 2020111743639 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN112289382A | 公開（公告）日 | 2021-01-29 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112289382A | 申請(qǐng)公布日 | 2021-01-29 |
| 分類號(hào) | G16B30/20(2019.01)I; | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 李本萍;王璐;王迪;周勛;陶琳娜 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 天津諾禾致源生物信息科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京康信知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 | 代理人 | 路秀麗 |
| 地址 | 301700天津市武清區(qū)武清開發(fā)區(qū)創(chuàng)業(yè)總部基地B07 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供了一種多倍體基因組同源染色體的拆分方法、裝置及其應(yīng)用。其中拆分方法包括：根據(jù)HiC數(shù)據(jù)與多倍體基因組序列比對(duì)得到的比對(duì)文件，計(jì)算基因組重疊群間的互作強(qiáng)度和重疊群內(nèi)的互作強(qiáng)度；根據(jù)各重疊群內(nèi)的互作強(qiáng)度對(duì)連接錯(cuò)誤的重疊群進(jìn)行打斷；利用打斷后的重疊群進(jìn)行相互比對(duì)，得到重疊群間的相似度；根據(jù)重疊群間的互作強(qiáng)度和重疊群間的相似度對(duì)所有重疊群進(jìn)行聚類，實(shí)現(xiàn)對(duì)多倍體基因組同源染色體的拆分。先通過利用重疊群內(nèi)的互作強(qiáng)度識(shí)別錯(cuò)誤連接的重疊群，并在錯(cuò)誤的地方進(jìn)行打斷。再通過識(shí)別重疊群間的相似性，利用重疊群間的互作強(qiáng)度和相似度高低進(jìn)行聚類，從而能夠有效的將同源染色體進(jìn)行拆分。?? |
