細胞Hi-C測序文庫的構建方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010725027.2 申請日 -
公開（公告）號 CN111778563A 公開（公告）日 2020-10-16
申請公布號 CN111778563A 申請公布日 2020-10-16
分類號 C40B50/06(2006.01)I 分類 組合技術〔8〕;
發(fā)明人 李新;劉貝貝;李瑞強;趙桂仿 申請（專利權）人 天津諾禾致源生物信息科技有限公司
代理機構 北京康信知識產(chǎn)權代理有限責任公司 代理人 天津諾禾致源生物信息科技有限公司
地址 301700天津市武清區(qū)開發(fā)區(qū)創(chuàng)業(yè)總部基地B07
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種細胞Hi?C測序文庫的構建方法。該構建方法包括采用體積≤800μL且甲醛終濃度為1.5～2.2％的交聯(lián)體系對105數(shù)量級細胞進行甲醛交聯(lián)固定，然后采用優(yōu)化的裂解體系及溫度對交聯(lián)細胞進行處理，得到細胞核懸液；對細胞核進行Hi?C文庫構建得到Hi?C測序文庫；細胞膜裂解液包括終濃度分別如下的成分：pH 7.8～8.2，9～11mM的Tris?HCl、9～11mM NaCl、0.1～0.3％的CA?630、1×的蛋白酶抑制劑。小體積體系對低細胞起始量固定，并優(yōu)化細胞膜裂解體系及反應條件，確保細胞核的完整性，提高了細胞核DNA的量及純度，進而提高建庫效率(提高有效數(shù)據(jù)的占比)。??