多重PCR引物設(shè)計(jì)方法和裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202210500808.0 申請日 -
公開（公告）號 CN114596968A 公開（公告）日 2022-06-07
申請公布號 CN114596968A 申請公布日 2022-06-07
分類號 G16H70/40;G16B20/30;G16B20/50 分類 物理
發(fā)明人 王維鋒;鄭新;姚繼成 申請（專利權(quán)）人 上海至本醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司
代理機(jī)構(gòu) 華進(jìn)聯(lián)合專利商標(biāo)代理有限公司 代理人 張靈莉
地址 200000 上海市中國（上海）自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)芳春路400號1幢3層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及一種多重PCR引物設(shè)計(jì)方法和裝置，方法包括：獲取腫瘤樣本的變異信息，根據(jù)所述變異信息選取預(yù)設(shè)數(shù)量的監(jiān)測位點(diǎn)以構(gòu)成監(jiān)測位點(diǎn)集合；根據(jù)每個監(jiān)測位點(diǎn)在參考基因組上對應(yīng)的目標(biāo)序列設(shè)計(jì)至少一個候選引物對，對于每個監(jiān)測位點(diǎn)選取一個候選引物對以生成監(jiān)測位點(diǎn)集合對應(yīng)的評估引物對集合；對評估引物對集合來自于不同候選引物對的兩兩引物進(jìn)行引物二聚體評估，根據(jù)評估引物對集合中所有引物的引物二聚體評估結(jié)果篩選合格的候選引物對作為目標(biāo)多重PCR引物。本發(fā)明的多重PCR引物設(shè)計(jì)方法，能夠針對性地對腫瘤患者的突變位點(diǎn)設(shè)計(jì)多重PCR引物，實(shí)現(xiàn)穩(wěn)定檢出豐度≥0.02％的ctDNA突變信息的目的。