HLA基因型別-SNP連鎖數(shù)據(jù)庫(kù)、其構(gòu)建方法、以及HLA分型方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201080070269.7 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN103221551B 公開（公告）日 2015-10-07
申請(qǐng)公布號(hào) CN103221551B 申請(qǐng)公布日 2015-10-07
分類號(hào) C12Q1/68(2006.01)I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 曹紅志;張偉;王煜 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京六合華大基因科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 中國(guó)國(guó)際貿(mào)易促進(jìn)委員會(huì)專利商標(biāo)事務(wù)所 代理人 深圳華大基因股份有限公司;北京六合華大基因科技有限公司
地址 518083 廣東省深圳市鹽田區(qū)洪安三街21號(hào)華大綜合園7棟7層-14層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明屬于基因組學(xué)和生物信息領(lǐng)域，涉及HLA基因型別-SNP連鎖數(shù)據(jù)庫(kù)、其構(gòu)建方法、以及HLA分型方法。具體地，所述構(gòu)建HLA基因型別-SNP連鎖數(shù)據(jù)庫(kù)的方法，包括如下步驟：a）選擇一個(gè)或多個(gè)HLA基因座的序列作為參考序列；b）將現(xiàn)有HLA數(shù)據(jù)庫(kù)中已知型別的HLA基因與參考序列比對(duì)，找出與參考序列的差異位點(diǎn)即SNP位點(diǎn)，得到每個(gè)型別相對(duì)于參考序列的SNP連鎖關(guān)系，構(gòu)建HLA基因型別-SNP連鎖數(shù)據(jù)庫(kù)。本發(fā)明還涉及確定HLA基因的SNP連鎖關(guān)系的方法，以及HLA分型裝置。本發(fā)明的分型方法實(shí)現(xiàn)了HLA的低成本，高通量、高準(zhǔn)確率、高分辨率的分型。