用于加速變異位點的識別的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201710717876.1 申請日 -
公開（公告）號 CN110021342B 公開（公告）日 2020-12-15
申請公布號 CN110021342B 申請公布日 2020-12-15
分類號 G16B20/00 分類 物理
發(fā)明人 張中海;李旭;徐俊韜;曾平;張春明 申請（專利權(quán)）人 北京哲源科技有限責(zé)任公司
代理機構(gòu) 北京泛華偉業(yè)知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 北京哲源科技有限責(zé)任公司
地址 100095 北京市海淀區(qū)中關(guān)村環(huán)?？萍际痉秷@龍芯產(chǎn)業(yè)園1號樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種用于加速變異位點的識別的方法，其將參考基因組的各染色體劃分為一個或多個區(qū)間，基于各區(qū)間的測序片段密度來設(shè)置各區(qū)間的處理優(yōu)先級，并根據(jù)各區(qū)間的處理優(yōu)先級來處理各區(qū)間中的測序片段，獲取各區(qū)間中與每個位點的堆疊相關(guān)的統(tǒng)計數(shù)據(jù)，從而判斷各位點是否發(fā)生變異。該方法將參考基因組劃分成多個區(qū)間，可以在多個核上同時并行處理各區(qū)間的相關(guān)數(shù)據(jù)，能有效利用現(xiàn)有的多核計算資源并縮短計算時間。