基于CUT&Tag技術(shù)分析DNA和蛋白質(zhì)互作的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110419129.6 申請日 -
公開（公告）號 CN113096738A 公開（公告）日 2021-07-09
申請公布號 CN113096738A 申請公布日 2021-07-09
分類號 G16B30/10（2019.01）I;G16B20/00（2019.01）I;G16B20/30（2019.01）I;G16B40/10（2019.01）I;G16B45/00（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 鄭洪坤;聶佩瑤;劉敏;張雪川 申請（專利權(quán)）人 北京百邁客生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 張璐
地址 101300北京市順義區(qū)南法信鎮(zhèn)順平路南法信段9號院1幢6層605A
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域，具體涉及基于CUT&Tag技術(shù)分析DNA和蛋白質(zhì)互作的方法。本發(fā)明通過將高通量測序后的Raw Data進(jìn)行處理（過濾接頭和低質(zhì)量的Read）獲得高質(zhì)量的Clean Data，將Clean Data比對到參考基因組獲得詳細(xì)的比對信息，利用MACS2軟件檢測Peak，并對檢測到的Peak進(jìn)行關(guān)聯(lián)基因注釋、關(guān)聯(lián)基因富集分析、motif分析、樣本間差異分析（多個樣本）等分析，提供了一整套基于CUT&Tag技術(shù)的高通量測序分析流程方法，其使用合理的并行設(shè)計，可快速實現(xiàn)大樣本量的CUT&Tag數(shù)據(jù)分析。