一種聯合基因組三維結構差異鑒定和轉錄組基因表達水平差異分析挖掘功能基因的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910917673.6 申請日 -
公開（公告）號 CN112562783A 公開（公告）日 2021-03-26
申請公布號 CN112562783A 申請公布日 2021-03-26
分類號 G16B15/00(2019.01)I;G16B25/00(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 鄭洪坤;劉福*;劉敏;李緒明;王晶;梁若冰 申請（專利權）人 北京百邁客生物科技有限公司
代理機構 北京路浩知識產權代理有限公司 代理人 商秀玲
地址 101300北京市順義區(qū)南法信鎮(zhèn)順平路南法信段9號院1幢5層508室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及生物信息技術領域，具體涉及一種聯合基因組三維結構差異鑒定和轉錄組基因表達水平差異分析挖掘功能基因的方法。本發(fā)明提供一種基因組三維結構差異的鑒定方法，包括在Hi?C數據的基礎上進行差異AB Compartment的鑒定、差異TAD的鑒定和差異Loop的鑒定，利用該方法可實現利用原位Hi?C數據對動植物進行不同層級的基因組三維結構差異的高效鑒定。本發(fā)明提供利用該基因組三維結構差異鑒定方法聯合轉錄組基因表達水平差異分析挖掘功能基因的方法，利用該聯合分析方法可實現從基因組三維結構與轉錄組兩個層面進行差異分析，進而實現對動植物功能基因的高效挖掘。??